滴灌的管道和滴头容易堵塞，对水质要求较高，所以安装过滤器；滴灌不能调节田间小气候，不适宜结冻期灌溉，在蔬菜灌溉中不能利用滴灌系统追施粪肥。 滴灌投资较高，要考虑作物的经济效益。

滴灌是按照作物需水要求，通过管道系统与安装在毛管上的灌水器，将水和作物需要的水分和养分一滴一滴，均匀而又缓慢地滴入作物根区土壤中的灌水方法。滴灌不破坏土壤结构，土壤内部水、肥、气、热经常保持适宜于作物生长的良好状况，蒸发损失小，不产生地面径流，几乎没有深层渗漏，是一种省水的灌水方式。
滴灌系统对管理人员的素质和农田集约化种植的要求较高，造价相对传统渠系灌溉要高，而且由于杂质、矿物质的沉淀的影响会使毛管滴头堵塞，滴灌的均匀度也不易。这些都是大面积推广滴灌技术的障碍。为促进农业的现代化和可持续发展，目前我国正全面大力推广节水灌溉技术，发展前景广阔。